De expertgroepen binnen ECP-EPN zijn zogenaamde 'denktanks' waarin experts op het gebied van een overkoepelend thema (bijvoorbeeld juridisch, beveiliging) deelnemen. De activiteiten van de expertgroepen variëren van het geven van (ad-hoc) advies inzake concrete (toekomstige) projecten en evenementen tot onderlinge kennisdeling tussen de leden.